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I. Los archivos y manuscritos de la Colección Genaro García * (los siguientes títulos son las subcolecciones de la Colección Genaro García)

• Lucas Alamán Papers, 1598-1853 *

• Juan Pablo Anaya Papers, 1810-1911 *

• Andrés de San Miguel Manuscripts, (16–)-(18–) *

• Mariano Arista Letters, 1832-1844 

• Achille François Bazaine Papers, 1862-1873 

• Collection on the Church in Mexico, 1580-1890 *

• Codices in the Genaro García Collection, 1500-1599 

• Ignacio Comonfort Papers, 1821-1918 (bulk 1847-1863) *

• Santos Degollado Collection, 1856-1907 (bulk 1856-1861) *

• Guillermo Dupaix Papers, 1804-1820 *

• Miguel María Echegaray Collection, 1857-1862 

• Pedro Escudero y Echanove Correspondence, 1845-1867 

• Letters to Manuel Fernández de Jáuregui and others, 1853-1870 (bulk1866-1869) 

• Juan Antonio de la Fuente Papers, 1856-1863 (bulk 1862-1863) 

• Genaro García Papers, 1896-1925 *

• Genaro García Photograph Collection, (18–)-(1920) 

• Letters to Francisco García Salinas, 1829-1857 (bulk 1832-1834) 

• Carlos García y Arriaga Papers, 1805-1835 *

• Valentín Gómez Farías Collection, 1770-1909 (bulk 1822-1879) *

• Jesús González Ortega Collection, 1851-1881 (bulk 1860-1861) *

• Letters to José Hipólito González, 1853-1873 (bulk 1861-1863) 

• Vicente Guerrero Collection, 1723-1843 (bulk 1822-1831) *

• Joseph Lebrón y Cuervo. "Enchiridión geométrico," trabajado por el Lic. D. Joseph Lebron ... para el uso del Senor Don Vicente de Herrera ... [N.p.], Año de 1783. 

• Guadalupe Hernández de Guerrero Papers, 1822-1847 

• Transcripts on the Indians of New Spain, 1579-1797 *

• Agustín de Iturbide Collection, 1813-1838 (bulk 1821-1824) *

• Teodosio Lares Papers, 1833-1867 (bulk 1863-1864) 

• Ramón Llerena Papers, 1863-1899 

• Manuel López Escudero y Cuevas Papers, 1780-1840 

• Manuel I. Madrid Collection, 1840-1902 (bulk 1841-1877) 

• Manning and MacKintosh Papers, 1714-1894 (bulk 1824-1883) *

• Antonio Margil de Jesús Collection, 1698-1911 *

• Rosendo Márquez Papers, 1878-1897 (bulk 1885-1892) 

• José Servando Teresa de Mier Noriega y Guerra Papers, 1808-1823 *

• José María Luis Mora Papers, 1795-1856 *

• José Ambrosio Moreno y Aguilar Correspondence, 1841-1868 

• Documents pertaining to the establishment of the Obispado de San Luis Potosí, 1792-1805 *

• Juan de Palafox y Mendoza Collection, 1563-1750 *

• Mariano Paredes y Arrillaga Collection, 1825-1876 (bulk 1840-1849) *

• Papers relating to the haciendas of José Mariano Sánchez y Mora, third Conde de Peñasco, 1721-1845 (bulk 1753-1844) 

• José Antonio Pichardo Papers, ca. 1790-1807 

• Juan Bautista Pomar, fl. 1582. "Relación de Texcoco," "Instrucción y Memoria," "Romances de los señores de la Nueva España," 1577-1582 

• Documentos relativos a la Reforma y a la Intervención Francesa en México, 1851-1910 *

• Collection on the Segundo Conde de Revillagigedo, 1794-1906 (bulk 1794-1799) 

• Mariano Riva Palacio Collection, 1716-1880 (bulk 1835-1875) *

• Vicente Riva Palacio Collection, 1790-1896 (bulk 1814-1896) *

• Atilano Sánchez Garayo Papers, 1815-1878 

• Prisciliano Sánchez Collection, 1822-1851 (bulk 1825-1827) 

• Antonio López de Santa Anna Collection, 1821-1878 *

• Carlos de Sigüenza y Góngora Collection, 1686-1704 *

• Minas de Sombrerete Collection, 1797-1851 (bulk 1825-1851) *

• Mariano Fernández de Echeverría y Veytia Collection, (16–)-1886 (bulk 1747-1776) *

• José Vicente Villada Collection, 1871-1889 

II. Los archivos y manuscritos de varias procedencias

• Records of the San Miguel Almolonga Hacienda and Sugar Mill, 1572-1946 *

• Altamirano, Ignacio. "El Zarco: episodios de la vida mexicana en 1861-1863." 1888 *

• Arriguñaga Family Collection of Yucatecan Broadsides and Manuscripts, 1762-1878 (bulk 1800-1840)  

• Libros borradores del Banco Mercantil de Yucatán (Mérida), 1890-1908 

• Richard E. Barthelemy Photograph Collection on the Tarascan Indians of Michoacan, 1975-1978 

• Paul Bartlett Drawings and Photographs of Mexican Haciendas, 1940-1973 *

• Miguel Bolaños Cacho Papers, 1885-1949 *

• Borden Clarke Collection, 1493-1890 (bulk 1716-1813) *

• William F. Buckley, Sr. Papers, 1880-1948 (bulk 1910-1922) *

• Collection relating to the General Claims Commission, United States and Mexico, 1917-1926 *

• Financial records of the Compañía Metalúrgica Mexicana and related enterprises, 1890-1968 (bulk 1890-1940) *

• Donald Cordry Collection relating to Mexican Masks, 1931-1978 *

• René D'Harnoncourt Photograph Collection, 1900-1925 *

• Joaquín and Mariano Degollado Collection, 1861-1923 (bulk 1861-1867) *

• Dan Dickey Collection, 1930-1955 

• John W. F. Dulles Papers relating to Mexico, 1798-1961 (bulk 1950-1959) 

• Records of the Ferrocarril Noroeste de México, 1910-1919 *

• Joaquín García Icazbalceta Manuscript Collection, (1500)-1887 (bulk 1524-1797) *
  • Relaciones Geográficas of Mexico and Guatemala, 1577-1585 *

• Lázaro de la Garza Papers, 1905-1939 (bulk 1913-1920) *

• Juan E. Hernández y Dávalos Collection, 1692-1886 (bulk 1811-1831) *

• Letters from Dr. Eyler Newton Simpson to Walter S. Rogers for the Institute of Current World Affairs, 1927-1928 *

• Records of the Presidio de San Felipe y Santiago de Janos, 1706-1858 *

• Records of land transactions by Edmund Kirby-Smith and Virginia Téllez de Kirby-Smith in the Isla de Tacamichapa, Veracruz, 1884-1945 (bulk 1895-1925) *

• Latorre Collection on the Kickapoo Indians of Mexico, 1898-1986, (bulk 1960-1975) *

• Samuel L. Lewis Photograph Collection of Pre-Columbian Archaeological Sites in Mexico, 1961 

• José Yves Limantour Papers, 1848-1911 *

• Chase Littlejohn Photograph Album, (ca. 1900-1925) 

• Charles Ferdinand Latrille, Comte de Lorencez Papers, ca. 1793-1879 (bulk 1862) 

• Harry Lund Collection, 1594-1967 (bulk 1820-1876) 

• John McAndrew Photograph Collection on 16th-century Latin American Architecture, ca. 1930-ca.1965 *

• Muse Collection relating to Mexico, Texas, and California, 1830-1844 *

• Edmundo O'Gorman Collection, 1542-(19–) 

• Photograph Collection on Pachuca, Hidalgo, 1910 *

• Placido Pastor Accounts Book, 1887-1898 

• Thomas Wentworth Peirce, Jr. Papers, 1900-1923 *

• Campbell W. Pennington Papers, 1872- *

• Records of El Potosí Mining Company, 1929-1952 (bulk 1931-1939) *

• Alejandro Prieto Collection, 1820-1917 

• Alan and Lillie M. Probert Collection, 1687-1987 *

• Christian Heilskov Rasmussen Photograph Collection of Churches in Yucatán, 1983-1987 *

• Paul Patrick Rogers Photograph Collection, ca. 1945-ca. 1955 

• Matías Romero Collection, 1837-1899 *

• Pablo Salce Arredondo Collection, 1594-1965 (bulk 1760-1880) 

• Archivo Parroquial Histórico del Templo de San Ignacio de Loyola en Parras de la Fuente, Coahuila, 1620-1910 (bulk 1720-1849) 

• Sánchez Navarro Family Papers, 1658-1895 (bulk 1740-1866) *

• A.J. Schmidt Collection of Lantern Slides of Mexican Subjects, ca. 1904-1921 

• Dorothy Schons Papers, 1586-1955 (bulk 1926-1955) 

• Justin H. Smith Collection, 1878-1929 *

• Jefferson R. and Lota M. Spell Papers, 1844-1972 (bulk 1920-1970) *

• W. B. Stephens Collection, 1488-1936 (bulk 1559-1848) *

• Tabasco Rubber Plantations Photograph Collection, ca. 1904 

• Libros de contabilidad de la negociación de pulques de la familia Tagle, 1897-1903 *

• Santiago Tapia Collection, 1823-1866 

• José Vasconcelos Manuscripts, 1935-1939 *

• Carlos Villalongín Dramatic Company Collection, 1848-1945 (bulk 1886-1926) 

• Elizabeth Wilder Weismann Collection, ca. 1930-ca. 1979 *

• Bernice Weiss Collection, 1547-1914 *

• Ejército Zapatista de Liberación Nacional. [EZLN, la marcha por la dignidad: pamphlets, flyers, brochures and posters, 1996-2001.] Materials collected by the Colectivo Zapatista División del Norte 

• Zeitlin & Ver Brugge Autograph Collection, 1568-1891 *